Program pendampingan diselenggarakan dengan berbagai daerah, baik Pemerintah Provinsi maupun Pemerintah Kabupaten/Kota. Hingga tahun 2019, setidaknya terdapat 63 bentuk kerjasama di bidang pendampingan pemerintahan yang telah diselenggarakan PPKK Fisipol UGM.

Berikut daftar kerjasama di bidang pendampingan pemerintahan yang telah dilaksanakan oleh PPKK Fisipol UGM sejak 2009 higga 2019.